Ketika Joseph Stalin kuasa konsolidasi pada paruh kedua tahun 1920, dasar agama berubah. Masjid ditutup atau berubah menjadi gudang di seluruh Asia Tengah. ketua agama dianiaya, sekolah agama ditutup dan Wakaf dilarang.[5] Kerajaan Soviet mengambil Paranji tabir bahawa wanita memakai (sebagai sebahagian dari Islam Hijab tafsiran dari Kesederhanaan) sebagai bukti bahawa wanita Islam ditindas, dan mula Hujum untuk mencuba dan tegas keluarkan.[4][6] Ini menjadi bumerang, dan kerudung menjadi lebih popular dari sebelumnya di kalangan para pekerja, bahawa sebelum ini banyak digunakan oleh menengah, kelas kaya[7] Kultus keperibadian Stalin, meninggalkan hampir tidak ada tempat untuk setiap sentimen keagamaan.[4][6]

Stalin juga secara paksa memindahkan beberapa negara kecil yang berada terutama di barat daya Rusia (Chechen, Ingushs, Crimean Tatar, Balkars, Karachais, Meshketian Turki , Kalmyks, Jerman dan lain-lain) dari tanah air mereka semasa Perang Dunia II, agar mereka bangkit melawan dia dalam menyokong Nazi Jerman.[8]

Selama masa pemerintahan Stalin, Crimean Tatar Muslim menjadi korban deportasi massal. deportasi telah bermula pada tarikh 17 Mei 1944 di semua n Krimea dihuni daerah. Lebih dari 32,000 NKVD pasukan mengambil bahagian dalam aksi ini. 193.865 Tatar Krimea dideportasi, 151.136 dari mereka ke dalam Uzbek SSR, 8597 ke Mari ASSR, 4286 ke Kazakh SSR, sisanya 29.846 ke oblast pelbagai s RSFSR.

Dari Mei hingga November 10105 Crimean Tatar meninggal kerana kelaparan di Uzbekistan (7% dari dideportasi ke Uzbek SSR). Hampir 30.000 (20%) meninggal di pengasingan selama tahun setengah oleh data NKVD dan hampir 46% oleh data dari aktivis Tatar Krimea. Menurut maklumat pembangkang Soviet, banyak Crimean Tatar dibuat untuk bekerja dalam projek skala besar yang dilakukan oleh sistem Gulag Soviet.[9]